山东省医学科学院创建于1958年，是集医学科研、临床医疗、疾病控制、研究生教育、科技支撑等职能于一体，山东省政府直属正厅级综合性医学科研机构。下属13个专业研究所（院）。
现有在职职工2195人，专业技术人员1936人，其中高级专业技术人员671人。有中国工程院院士1人，获省部级以上荣誉称号或奖励的个性科技人员66人，山东省“泰山学者”特聘教授（专家）2人，博、硕士生导师138人。25位两院院士和37位国际著名外籍专家担任顾问、客座教授。
有1个省部共建国家重点实验室培育基地、1个国家卫生部重点实验室、2个山东省高水平重点实验室、5个省级重点实验室、3个省医药卫生重点实验室、7个省医药卫生重点学科、6个联合博士学位授予学科、20个硕士二级学位授予学科、9个院重点学科、6个院特色专科、3个国家药物临床试验机构，是国家人事部批准的“博士后科研工作站”单位。
1981年以来，山东医学科学院先后承担科研项目1423项，获奖705项，其中国家科技进步奖7项，省（部）级科技进步奖259项。与世界6大洲30多个国家建立了有效的科技合作关系。全院净资产11.24亿元（固定资产8.52亿元），综合实力位居全国省市医学科研院所前列。